Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX21Q969T3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms