Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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