Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD50Q92878 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD50Q92878 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms