Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARPC1AQ92747 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARPC1AQ92747 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms