Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
TOPBP1Q92547 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TOPBP1Q92547 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms