Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CSRNP3Q8WYN3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms