Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3RF3Q8TEJ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3RF3Q8TEJ3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms