Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20■□□□□ 0.79
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MCOLN3Q8TDD5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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MCOLN3Q8TDD5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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MCOLN3Q8TDD5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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MCOLN3Q8TDD5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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MCOLN3Q8TDD5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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MCOLN3Q8TDD5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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MCOLN3Q8TDD5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCOLN3Q8TDD5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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