Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP38Q8NB14 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms