Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD53Q8N9V6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms