Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYCP3Q8IZU3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms