Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms