Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWA6

CCDC60, Coiled-coil domain-containing protein 60, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC60Q8IWA6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC60Q8IWA6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC60Q8IWA6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms