Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB11FIP4Q86YS3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
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