Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01551Q86U37 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms