Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPM2Q86SE8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms