Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG9AQ7Z3C6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG9AQ7Z3C6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms