Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MICAL3Q7RTP6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAL3Q7RTP6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms