Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUFY3Q7L099 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUFY3Q7L099 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms