Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KNDC1Q76NI1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KNDC1Q76NI1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms