Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP50Q70EL3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP50Q70EL3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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