Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYDE1Q6ZW31 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYDE1Q6ZW31 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms