Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPGS1Q6ZTW0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPGS1Q6ZTW0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms