Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPOCD1Q6ZMY3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms