Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCBE1Q6UXH8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCBE1Q6UXH8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms