Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM220Q6QAJ8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM220Q6QAJ8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM220Q6QAJ8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM220Q6QAJ8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM220Q6QAJ8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM220Q6QAJ8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM220Q6QAJ8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM220Q6QAJ8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM220Q6QAJ8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM220Q6QAJ8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM220Q6QAJ8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms