Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC27A4Q6P1M0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC27A4Q6P1M0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms