Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EFCAB12Q6NXP0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCAB12Q6NXP0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms