Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT80Q6KB66 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms