Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
CARMIL2Q6F5E8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
CARMIL2Q6F5E8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms