Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALS2CLQ60I27 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALS2CLQ60I27 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms