Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USPL1Q5W0Q7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
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USPL1Q5W0Q7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
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USPL1Q5W0Q7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
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USPL1Q5W0Q7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
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USPL1Q5W0Q7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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USPL1Q5W0Q7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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USPL1Q5W0Q7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USPL1Q5W0Q7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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