Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SUSD4Q5VX71 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUSD4Q5VX71 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms