Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDHAF4Q5VUM1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDHAF4Q5VUM1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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