Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRCH2Q5VUJ6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms