Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms