Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO47Q5MNV8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO47Q5MNV8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms