Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms