Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CT47A1Q5JQC4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47A1Q5JQC4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms