Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAVIN4Q5BKX8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAVIN4Q5BKX8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms