Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC178Q5BJE1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms