Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms