Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms