Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP221Q4G0U5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms