Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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