Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TWISTNBQ3B726 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms