Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTN1Q16799 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
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