Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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NRF1Q16656 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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NRF1Q16656 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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NRF1Q16656 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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NRF1Q16656 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
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NRF1Q16656 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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NRF1Q16656 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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NRF1Q16656 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NRF1Q16656 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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