Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC18A3Q16572 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC18A3Q16572 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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