Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNHIT3Q15649 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNHIT3Q15649 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms